盔甲裏面的活動仍由 DNA 主導：102-1 分子生物學 - 歡迎選修、接受挑戰

The NTU Style : 蚜蟲成為新興發育模式物種的故事

 

全文請詳閱 "台大校友雙月刊 87 期"

張俊哲老師團隊之研究成果 (2002-2013)

研究成果刊登於期刊封面

* 通訊作者

+ 等同貢獻

Chang, C-c.†*; Hsiao, Y. M.†; Huang, T. Y.; Cook, C. E.; Shigenobu, S.; Chang, T. H. (2013) Noncanonical expression of caudal during early embryogenesis in the pea aphid Acyrthosiphon pisum: maternal cad-driven posterior development is not conserved. Insect Molecular Biology  (in press) (SCI)





Lu, H. L., Tanguy, S., Rispe, C., Gauthier, J., Walsh, T., Gordon, K., Edwards, O., Tagu, D., Chang, C-c.*, Jaubert-Possamai, S.* (2011) Expansion of Genes Encoding piRNA-Associated Argonaute Proteins in the Pea Aphid: Diversification of Expression Profiles in Different Plastic Morphs. PLoS ONE 6(12): e28051. doi:10.1371/journal.pone.0028051 (* co-corresponding authors)

科學影像刊登於教科書封面

Yi-Chung Chen, Bo-Kai Wu, Cheng-Ying Chu, Chia-Hsiung Cheng, Hau-Wei Han, Gen-Der Chen, Ming-Ting Lee, Pung-Pung Hwang, Koichi Kawakami, Chun-Che Chang, and Chang-Jen Huang* (2010) Identification and characterization of alternative promoters of zebrafish Rtn-4/Nogo genes in cultured cells and zebrafish embryos. Nucleic Acids Research 38:4635-4650. (SCI)

The International Aphid Genomics Consortium (2010) Genome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum. PLoS Biology 8(2): e1000313. doi:10.1371/journal.pbio.1000313. (Chun-che Chang is designated as a leader of the germline gene annotation group in the paper; Cover story; cover image of this issue is contributed by the Chang Lab) (SCI)



Ting-Yu Huang, Charles E. Cook, Gregory K. Davis, Shuji Shigenobu, Rita P.-Y. Chen, and Chun-che Chang* (2010) Anterior development in the parthenogenetic and viviparous form of the pea aphid, Acyrthosiphon pisum: hunchback and orthodenticle expression. Insect Molecular Biology 19: 75-85. (SCI)



Shuji Shigenobu*, R. D. Bickel, J. A. Brisson, T. Butts, C.-c. Chang et al. (2010) Comprehensive survey of developmental genes in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum: frequent lineage-specific duplications and losses of developmental genes. Insect Molecular Biology 19: 47-62.

Yi-Chun Tsai, Leellen F. Solter, Chih-Yuan Wang, Huai-Sheng Fan, Chun-che Chang*, Chung-Hsiung Wang* (2009) Morphological and molecular studies of a microsporidium (Nosema sp.) isolated from the three spot grass yellow butterfly, Eurema blanda arsakia (Lepidoptera: Pieridae). Journal of Invertebrate Pathology 100: 85-93. (SCI)

Chun-che Chang*, Ting-Yu Huang, Charles E. Cook, Gee-Way Lin, Chun-Liang Shih, and Rita P.-Y. Chen (2009) Developmental expression of Apnanos during oogenesis and embryogenesis in the parthenogenetic pea aphid Acyrthosiphon pisum (Hemiptera: Aphidoidea). International Journal of Developmental Biology 53: 169-176. (SCI)

Taro Mito, Taro Nakamura, Isao Sarashina, Chun-che Chang, Shotaro Ogawa, Hideyo Ohuchi, and Sumihare Noji (2008) Dynamic expression patterns of vasa during embryogenesisin the cricket Gryllus bimaculatus. Development Genes Evolution 218: 381-387. (SCI)

Chun-che Chang*, Ting-Yu Huang†, Chun-Liang Shih, Gee-Way Lin, Te-Pin Chang, Hui Chiu, Wen-Chang Chang (2008) Whole-mount identification of gene transcripts in aphids: Protocols and evaluation of probe accessibility. Archives of Insect Biochemistry and Physiology 68: 186-96. (SCI)

Chun-che Chang*, Hui Chiu, and How-Jing Lee (2008) Identification of nuage-like structures in the panoistic ovarioles of the German cockroach Blattella germanica (Linnaeus). Formosan Entomologist 28: 1-10. (Cover story)

Gee-Way Lin, Shau-Lin Lu, Ting-Yu Huang, Chun-Liang Shih, Wen-Jer Wu*, and Chun-che Chang* (2008) Molecular identification of weevils significant for customs inspection and quarantine importance. Formosan Entomologist 28: 43-55. (This paper was written in Chinese)

Chun-che Chang*, Gee-way Lin, Charles E. Cook, Shwu-bin Horng, How-jing Lee and Ting-yu Huang (2007) Apvasa marks germ-cell migration in the parthenogenetic pea aphid Acyrthosiphon pisum (Hemiptera: Aphidoidea). Development Genes Evolution 217: 275–287 (SCI)

Chun-che Chang*, Wen-chih Lee, Charles E. Cook, Gee-way Lin, and Tschining Chang (2006) Germ-plasm specification and germline development in the parthenogenetic pea aphid Acyrthosiphon pisum: Vasa and Nanos as markers. International Journal of Developmental Biology 50: 413-421. (Cover story

; cited by Cell (2006) and PNAS (2007)) (SCI)

 (2003 年以前的發表)

Chun-che Chang, Peter Dearden, and Michael Akam* (2002) Germline development in the grasshopper Schistocerca gregaria: Vasa as a marker. Developmental Biology 252: 110-118. (SCI) (Cover story)

Chun-che Chang and Charles E. Cook* (2002) Trends in genomic “evo-devo". 3 (7): reports 4019.1-4019.2. Genome Biology. (peer-reviewed) (SCI)

“Ask Why”，讓學習變得更有趣！(推薦序）

在臺大教授分子生物學 (分生) 的過程中，我經常挑戰學生兩件事：

(1) 請捫心自問，有沒有把握將 ”DNA” 與 ”RNA” 的英文全名正確地寫出來？

(2) 請捫心自問，背了那麼多的專有名詞 (含縮寫) ，對於實際從事實驗工作，到底有多少的幫助？

讓我驚訝的是：就算已經明白地表示寫出 DNA 和 RNA 的英文全名，將是期中考的必考題，但仍有為數不少的同學無法將 “deoxyribonucleic acid (DNA)” 或是 “ribonucleic acid (RNA)” 一字不差地答出。更令人百思不解的是：就算明知死背專有名詞無助於實驗的設計與進行，許多同學仍在考試前囫圇吞棗地記了一堆不知所云的英文專有名詞，希望腦中的暫存記憶，能提高猜中答案的機率。當然，這樣的學習態度不可能獲致令人滿意的成績。但更大的副作用還在後頭：同學們對分生漸行漸遠，不僅萌生退意，甚至產生了敵意！

為何同學們不願腳踏實地治學，以及主動釐清分子反應機制？重要的關鍵之一，在於興趣缺缺。實際上，這樣的問題並非僅存於分生一科，許多科目的學習瓶頸亦頗為類似。究其個中原因，我發現同學們仍把大一、大二、大三，當作高四、高五、高六，沿襲被動的學習方式，習慣「等待標準答案」，而非主動發掘答案。講得更明白些，同學們已習於、惰於、甚至懼於 “Ask Why (問為什麼)”。因為 “Ask Why” 在準備升學考試的過程，似乎效用不大，甚至曾經試著想 “Ask Why” 而被老師潑冷水的同學，亦不乏其人。就我個人的觀察，一旦在學習的過程停止 “Ask Why”，接下來連思考 “Why Me (為何是我？)” 的動力都會大幅下降。如此一來書讀不懂，又逃避面對自己、面對人生，自然而然地會選擇 「面對電腦」。然而，對於解決學習和人生的問題卻幾乎沒有助益。

我很高興看到武村政春博士繼《世界第一簡單分子生物學》，又推出《3 小時讀通 DNA 誕生之謎》這本極富創意的大作。這本書最大的特色，就是不斷地以 “Ask Why” 引導讀者瞭解 DNA 的真面目。同時，藉由不斷地 “Ask Why”，啟發大家想更進一步探索 DNA 的強烈動機。不約而同地，近幾年改版的分生或遺傳學原文教科書，紛紛以更顯著的篇幅介紹科學家與他 (她) 們的科學貢獻，甚至在每章另闢專欄作頗為詳盡的介紹。武村博士這本新著，乃是以更生動的筆觸，佐以最親切活潑的插畫，將從事 DNA 與 RNA 研究的科學家以及其研究成果，呈現於讀者眼前。難能可貴的是：藉由 “Ask Why”，把科學家們曾經想過，或還正在構思的理論，和讀者們分享。

由於教育的普及，大部分的同學在國中階段就學到了 DNA，接著高中再多學一些；到了大一的普通生物學和大二的生物化學又再學了一遍 “進階英文版的 DNA”。因此，到了大三的分生課程，許多同學們一開始對於學習 DNA 的構造和化學特性都掉以輕心，以為只是炒冷飯。等到察覺有許多的重點是以前未曾釐清和吸收，不幸為時已晚，第一次的期中考自然慘遭滑鐵盧，只能等待第二、三次的期中考敗部復活。面對如此之 “學習疲乏症候群”，唯有改以經常 “Ask Why” 的學習方式，才能讓自己更加積極、更加謙卑地面對遺傳密碼的奧祕。武村博士這本饒富創意的大作，相信對於治癒 “DNA冷感症” 或是 “DNA恐懼症”，應頗具療效。對於 DNA 的初學者，我相信您們一開始就會被武村博士 “Ask Why” 的學習方式啟發，再也不敢輕看 DNA 雙螺旋，並且產生濃厚的興趣，把具有超過三十億年歷史的 DNA，在三小時內先睹為快！

當然，我更期待讀者們接受、享受 “Ask Why” 這樣的學習方式後，能夠無所畏懼地挑戰 “Why Me” 的這個大哉問，進而開創更真誠積極的人生！

臺灣大學昆蟲學系/生物科技研究所

張俊哲

2013 年 4 月

Happy New Year : 教學發展中心第 69 期編輯手札

第 69 期編輯手札

文／張俊哲 (臺大昆蟲系副教授)

各位讀者：大家好！

「把年輕的影子

用歲月風乾  再醃起來  加塩

等老了

拿出來  下酒」

　　這是最近造訪家鄉一家餃子館的牆上所看到的詩 (請參閱照片)，在農曆年前讀起來別有一番感受：過去一年的點點滴滴都還來不及整理、珍藏，新的一年就馬上來到；感覺起來，日子好像過得還算充實，只是匆忙了些，但匆忙到有時覺得連整理 iPhoto 當中的數位相片也覺得累。令人欣慰的是還好每個月能在電子報和大家分享心情和感想，有幸留下「歲月的下酒菜」！

　　然而，要做出美味的下酒菜還需要有一套好的食譜，尤其對於剛學做菜的人，更是如此。我覺得每一期的「新生書院」專欄，好似提供大一新鮮人一套「歲月的食譜」，讓新生進入 “All You Can Cook” 的「大學廚房」當中不致驚慌失措，並得以精進廚藝，烹調出一道一道的「歲月美味」。本期我們有幸刊載經濟學系吳聰敏老師的新生書院演講：“1460+1”。或許您會馬上想要在本文中找出 “1460+1” 的涵意，甚至將文章當中所出現的數字加減乘除一番，不過您會遍尋不著，無法破解這個數字的奧祕－我，就是如此。經就教吳老師，才猛然發覺原來 “1460+1” 是大學四年的天數總合 (365*4=1460 (天)，加上閏二月的 1 天)！吳老師喜歡攝影，所以他以心儀的攝影家 Jay Maise 給年輕攝影師的建議勉勵大一新生：(1) 持之以恒比才氣更重要；(2) 找到想做的事，做想做的事；(3) 要有道德，進而影響他人；(4) 不要放棄。我想第二點到第四點屬於各個新生書院演講內容之「共同菜色」，其重要性自然不在話下。雖然第一點屬於「私房菜」，但是對從小倍受肯定，甚至倍受呵護的臺大新生，絕對是做出一道好菜所必備的食譜。我有信心這道菜:Perseverance trumps talent (持之以恒勝過才氣)，甚至可達「藥膳」之果效，治癒一些莫名其妙的「臺大驕縱宿疾」。

　　另外四篇文章計有令人感動指數破表的「教師感恩週」和「新師營」的深度報導、資工系許永真老師的訪談、以及瀏覽器附加元件 “ Awesome Screenshot Plus” 的使用。因離除夕前截稿發刊只剩不到 30 分鐘的時間，在此法進一步為讀者們導讀，敬請大家在農曆春節間好好品嚐這幾篇佳作，保證比看大部份的電視節目受益。

　　最後，謹以在上述館子中所照的一張近照向大家道聲恭賀新禧！原本只想保留發福身影旁的蒼勁書法，後來猛然發現上頭的「熱心教育」匾額似乎是對自己，也對許多從事教學研究讀者的最佳提醒，因而捨不得用 Photoshop 將它裁掉。的確，失去了「熱心教育」的初衷，不管再加多少的塩，歲月都將會食之無味！

再次祝大家新年快樂！

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　俊哲  敬賀

                                                                                                        2012. 2. 8

註：相片中的詩應是改編詩人夏宇「甜蜜的復仇」，原文為：把你的影子加點鹽

醃起來  風乾  老的時候  下酒。

推薦：進階科學研究計畫管理

Fall Forward : 教學發展中心第 68 期編輯手札

每當我餵食青萬隆 (一種攀鱸科的鬥魚)，牠總以積極的態度穿越水草，哪怕冒著被水草割傷的風險，也要奔向飼料，以 "fall forward" 的精神，達成牠一天最重要的目標。(圖文：張俊哲)

文／張俊哲 (臺大昆蟲系副教授) 各位教學發展中心電子報的讀者：大家好！新年快樂！ 　　我週遭有一群朋友，喜歡在跨年之際為新的一年命名，代表他們對新年的盼望與期許。平常我自認靈感頗豐，有時也會來點多愁善感，照理說應該有不錯的命名點子。然而事實卻恰好相反，我經常在歲末年終腸枯思竭，只希望在上傳國科會計畫書後不要爆肝，新的一年叫做「健康年」就可堪告慰。今年的跨年雖輪空，暫時躲過寫計畫之苦，卻因興奮地忙著用新買的智慧型手機發簡訊拜年，造成瞳孔肌肉緊繃過久，接著腦袋瓜亮起紅燈，依舊以「健康年」收場。 　　不過在頭腦清醒後，我猛然發現 2013 年竟是我在臺大服務的第十個年頭！絕不肉麻地說：2003 年彷彿昨日，我永遠喜歡那份青澀，那份被親友叫 “臺大教授＂仍會心跳加速的感覺！然而歷經近十年的歲月，莫名的滄桑感好像逐漸將脈搏調慢，親友的恭維不再那麼令人興奮；研究教學的重擔有時使自己更像一名匆促上場的打擊者，被迫快速揮棒，強迫取分，忘了打球的樂趣。幸運的是近兩年我稍微找回一些熱情，因為我發現不管教書、做研究，唯有先讓自己感動，才能感動課堂中的同學、感動實驗室的研究生、甚至感動計畫評審。這一切的一切，都源自於真誠地面對自己，讓順境得享感恩的出口，讓傷口也得獲醫癒的空間。 　　在 2013 年一月份的電子報，我們所收錄文章的共同特色都在於鼓勵讀者勇於面對心靈深處的那份真誠。經濟系的黃貞穎老師分享她由醫學系轉到經濟系的心路歷程，除了感性地回顧當年戲劇化的生涯轉折，文中她更以豐沛的理性視野，勸勉大一新生要非常認真地發掘自己真正興趣之所在，因為 "True pleasure is a serious business" (意即「深刻地去瞭解某個領域，才能產生深刻的快樂感」)。我敢猜測：若當時出席黃老師演講的大一新生沒有被這段劇力萬鈞的觀點所震懾，一定是一開始就趴在桌上睡覺！我相信那些私底下玩手機的同學都能被這麼精彩的人生轉折與論點「拉回來」！另外，外文系的奚永慧老師以非常吸引人的講題：「和英文談戀愛」，分享學好英文的祕訣。有異於坊間速食、教條、甚或填鴨式教法，奚老師鼓勵大家面對英文的學習必須要先將自己的心態調整至談戀愛的狀態 – 也就是「每天用心去愛她 (他)」，而且要「有誠意」、「瞭解對方」、「花時間多關心」。讀完整篇奚老師的講稿，您一定會對學好英文有更深刻之見解。同時，您會有一個很棒的附加禮物：更會談戀愛。 　　相較於上述的兩篇文章皆以探索「內心的世界」為出發點，土木系康仕仲老師以「教育就像育樂事業」為題，分享他如何「打動學生的內心世界」，使同學願意「主動學習」和「學習如何學習」 – 這是屬於「由外而內」的方式來誘導同學產生高度的學習熱忱。而廖東坤導演在「雲海上的島嶼」紀錄片放映座談，則是將探索心靈的觸角拉到美麗的大自然，鼓勵大家多接觸大自然這個最棒的「心靈調節器」 – 因為我們會頓悟當煩惱置身於大自然當中，是何等的渺小。無獨有偶，李侑龍設計師有關如何在電腦和手機同步設定信箱、行事曆、聯絡資訊的文章，好像是為剛使用智慧型手機的我所寫的！其實要我強捨那隻摔不壞的傳統手機，心中確有幾分掙扎，畢竟用久了、用順了，已和它產生了「革命情感」。我之所以讓老手機退役的原因，在於它很難使我的信箱與行事曆同步，對於記下突發的行程與乍現的靈光，確有不便之處，也因此希望生平第一支智慧型手機，可以順利成為「心靈捕手」。同時也期待侑龍的文章使您在天涯海角記下內心的感動之後，得以順利回傳回書房的電腦，留待日後好好品味！ 　　還記得在上期的編輯手札我向大家提到跑步健身的掙扎嗎？說也奇怪，當我願意將自己的軟弱分享後，惰性的牽制力反而變小，迄今已順利向學校的健身房報到數次！探討其中的原因，我發覺和勇於真誠地面對自己息息相關，這也是本期幾篇文章所散發的共同信息。當然，另一個原因在於我受到丹佐華盛頓 (Denzel Washington，美國名演員) 在 2011 年對賓州大學畢業生的演講所激勵：這篇以 "Don’t Fall Back, Fall Forward" 為名的演講 (詳見：http://www.youtube.com/watch?v=paPeq7liP8o)，鼓勵賓大的同學勇於冒險、以開闊的心胸面對人生、接受不同觀點、永遠別氣餒、永遠別退縮、貢獻你擁有的一切。我想，這正是「化感動為行動」的最佳詮釋，讓我們在 2013 年的年初一起共勉！(張俊哲)