2014年2月15日 星期六

Sum of All Fears, Sum of All Triumph: 收到 102-1 分子生物學教學評鑑有感


圖案修改自 Wikipedia

剛剛收到 102-1 分子生物學的教學評鑑,內心百感交集。在打開檔案之前,不知歷經兩次大考,又要面臨期末考的同學,在十七週漫長的課程轟炸後,會寫下什麼樣的評價。按下滑鼠的前夕,竟和點開期刊評審委員的 email 有著相似的心境綜合和這一切的感覺,讓我聯想起 Tom Clancy 的小說 "恐懼的總和 (The Sum of All Fears)" ,或許書名正道出我尚未釐清的心境。點開檔案後,看到同學的肯定或批評,心境隨即沈澱下來,有點像是收到稿件可被接受刊登但尚需修改 (accepted with revisions) 那樣的感覺,我將這樣的感受稱之為 "喜悅的總和 (The Sum of All Triumph)" 

        在網路上 Google 近兩年學生對我分生教學的評鑑,發掘資料有點斷層,大概都轉往臉書 (Facebook) 去了。今年每幾乎每一科同學的評語都有字數明顯減少的現象,不知是否與此有關。我非常瞭解一但有了自己的臉書 ,一定會廢寢忘食地經營,因此迄今尚未 "露臉"。因此鼓起勇氣將學生的評語貼上,希望來年選課前讓同學瞭解授課的風格與特色。再次感謝大家!


(續) 附上前幾年評語的節錄 ( 張俊哲分子生物學)
*會引導我們的思路,不是一開始就把一堆知識直接塞給我們,而是會要我們思考,我們想了解的問題是什麼?當年的科學家看到這個結果會如何做解讀?讓這些知識在我的腦海裡留下更深刻的印象,也讓我更明白在實驗裡如何去研究
一個問題。
*能夠上老師的課更讓我感動阿!!每次上課都覺得非常有趣,不論是老師上課的風格還是各種課外分享,讓人學習起來一點都不枯燥乏味,非常榮幸能夠修到老師的課,太棒了!!!
*能感受到老師對教授的熱忱以及對科學的愛好,上課上的很舒服!謝謝教授!
*老師非常認真教學;老師很用心,以最新的資料當作教材。
*等了一年來上老師的課,果然非常值得。老師您在課堂上的每一字每一句,都讓台下的我們感受到您教學的熱忱以及認真的態度。而坐在台下的我,雖不能誇口自己見過各式各樣的老師,但我能保證老師您絕對是那最一流的老師之一。最後,依然要再一次謝謝老師這半年的指導。
*老師真的非常非常的認真,繁瑣的分生被歸納於重要觀念真的很受用。
*老師總是認真地準備上課的教材,讓我們能在短短的一學期對分子生物學這門學問打下基礎。更難能可貴的是,即便此課程對學生來說負擔頗不輕鬆,但一學期下來反而讓我對分子生物學更加充滿興趣。謝謝老師!老師很熱情,讓我
感受到分子生物學家的熱情!
*老師上課講解非常詳細有些在基礎生物不太理解的內容我也能貫通了!
*老師上課認真,課程內容雖然稍有難度,可是老師講解得很清楚,並且之後有一再地複習觀念,讓同學更能吸收。
*老師真的是充滿熱情與幽默的一位好老師,身為藥學所研究生,每次聽老師講到實驗的部分都喜感親切,也期許自己能有像老師一樣的動力發現更多生命的感動,希望老師能繼續開這門 造福學弟妹!
*專業!熱情!可以感覺出來老師很用心的準備上課的內容,課程也很充實!
*謝謝老師這學期的授課,講解清楚又容易懂。老師非常懂得做學問、表達知識的方法!
*Extremely wonderful! 老師很用心準備教學! 專業!熱情!
*Thank you!! 老師上課講解的十分清晰,讓我們在課堂上即能完全吸收內容。老師也常和我們分享一些實驗的小技巧,覺得頗為受用,也謝謝老師常在課堂上分享些特別並且能讓人有所啟發的小故事,總是很激勵人心呢! 讓人能不畏懼的繼
續學習下去,讓人更加喜愛分子生物學!
*A wonderful class^^~ Thanks a lot! 很少見到這麼用心準備課程又風趣的老師,真的非常感謝老師這學期的指導~老師超熱血的,對於學問知識的熱忱能感動學生。
*我非常認同學習分子生物學,應該學習機制的運作及原理,而不是去背誦一大推專有名詞。非常慶幸能夠上到張俊哲老師開的課,希望老師繼續努力,老師上課真的非常不錯,努力將複雜的東西變的簡顯易懂。老師對於分生的熱忱我們都
看的到,也深深被感染到,謝謝老師的指導。

*老師是我的恩人! 成功激發我對於分子生物學的興趣!我也期許將來能和老師一樣做一名熱情的科學人!


2014年1月23日 星期四

堅毅的浪漫特質 (Romantic GRIT) -- 臺大教學發展中心電子報第 73 期編輯手札

http://ctld.ntu.edu.tw/_epaper/ 第 73 期編輯手札
文/張俊哲 (臺大昆蟲學系副教授)



Romantic GRIT – 找尋基因表現與奮鬥人生的浪漫元素。本圖為 2013 年 12 月 31 日與學生分享「基因調控的浪漫抉擇」電子板書。藍色:RNA 聚合酵素 (RNA Polymerase);綠色:參與基因轉錄的基本因子 (general transcription factors);黃色:強化序列 (enhancer);白色:三角錐狀體為活化蛋白 (activator protein),長線條為 DNA,箭頭為訊息傳遞方向;粉紅色:基因表現序列所在區域。請讀者不用拘泥專有名詞,只需稍加感受基因調控之複雜與精準即可。圖文:張俊哲。  

           2013 年最後一天的傍晚,我上了本學期最後的一堂分子生物學。利用加課的最後三十分鐘,終於將基因如何調控胚胎的發育,較為完整地介紹給同學。順利地完成了 17  4 學分的重課,理應覺得如釋重負,但心裏竟有一絲說不出的惆悵。

  偕課程助教走向停車場的過程中,我才猛然回想起剛剛想要和同學分享的新體會 – 「基因調控的浪漫抉擇」。因此,利用隔週期末考試開始前的五分鐘,我藉由幫同學複習基因表現的原理,鼓勵同學們思考:

  「為何一個基因的表現要花這麼大的力氣?整個過程不僅需要基本的酵素群,更要勞駕相隔數百或數千個核酸之遠的強化序列來結合活化蛋白,讓活化蛋白再透過一大群的媒介因子,使得啟動的訊息可傳至聚合酵素,正式揭開基因表現的序幕。而且這樣的大工程,也只不過是我們數兆個細胞當中一個基因表現的縮影!即便是處於昏睡狀態,如此波瀾壯闊的基因調控也不曾停歇,否則生命將無法延續。為什麼細胞要花這麼多功夫,動員那麼多調控因子,只為了啟動一個基因 (參閱附圖)?而這樣不怕麻煩地使命必達,難道會遜於送上九百九十九朵玫瑰或人世間其它形式的浪漫?」

  我很慶幸在講解上述內容的當時,班上沒有任何一個同學打瞌睡。然而,這五分鐘卻也是本學期上課全班沒有一個人打瞌睡的唯一時段!大多數的時間,總有幾位同學一上課便體力不支而進入昏睡狀態,而且在下課十分鐘趴著睡覺竟漸漸成了「全民 (班) 運動」……
  
        如果讓自幼貧困失學的吳寶春先生來目睹上述之「昏睡即景」,不知他會作何感想?不論答案的本質是憐憫、感歎、甚或責備,在此我都不願意多做揣測。然而,我非常願意將各位讀者的注意力再次帶進青年吳寶春的世界 – 「從最後一名到世界第一」的下集。藉由他的口述,讓大家明白一個麵包小師傅如何在汗水和淚水交織的奮鬥歷程,勇奪世界麵包大賽冠軍。無庸置疑地,吳先生的成功絕對是發揮「GRIT (堅毅)」特質之最佳例證之一 (請參閱上期電子報)。但是又有多少自幼貧困失學的年輕人,甚或是衣食無虞的同學,只因著主客觀的挫折,或是尚未或從未臨到的壓力,就怨天尤人,自暴自棄?對許多人而言,或許吳寶春的例子確實感人,GRIT 之重要性也無庸置疑,但它們不過就是讓人體驗「知易行難」的素材而已。難道,真的是如此的無奈?

  非也!在吳先生的演講稿中,我很興奮地發現了驅動 GRIT 的「浪漫元素」:他可以每天花十幾個小時,只為了做出入口回甘的麵包;他可以因著巴黎的雪花輕吻臉頰,而一償進入童話世界的宿願;他可以從比賽會場看到自己國家的國旗飄揚,因而領悟生命的價值,而不再自卑。這些看似樸拙的情懷,其實正是讓他一次次擦乾淚水、克服困境、啟動堅毅特質的強大驅策力。因此,如果不要將浪漫限縮於愛情的世界,我們從微觀的基因調控到人世間許多的純全良善,都處處可發掘到浪漫的元素。例如本期所報導的「新師營」就蘊含許多「浪漫的堅毅 (romantic GRIT):從耗時數個月的籌劃、整備、通知、協調、執行,都是為了新進教師能在239 公里遠的溪頭山區待上三天後滿載而歸,並且希望藉由開學前的充電,讓新師們在競爭激烈的學術環境中,能掌握生涯發展之要領,並保有教學研究的高度熱忱。其實在風光明媚的溪頭實驗林辦活動,本身就是顯而易見的浪漫。但更深層的浪漫,則在於工作人員默默地付出,以及受邀講員能無懼後浪推前浪的兢爭威脅,將寶貴的經驗傳授給後進的情懷。

  用同樣的角度來思考林英智老師為何願意花 30 年的時間來耕耘普通化學的教學 (參閱「建構物質科學的抽象概念」),以及為什麼學校要花力氣將教學演講內容放到 YouTube (參閱「臺大YouTube EDU 頻道簡介」),同時幫助大家製作教學媒體 (參閱「掌握製作小技巧,自創吸睛優質的教學短片!(下)」),就不難發現正是那股浪漫的情懷再度呼喚失去的夢想和熱情,使得臺灣大學不致被急功近利的潮流完全吞噬,甚至有時還可得勝有餘!

  隨著農曆年節的到來,先祝福大家由內而外過個浪漫而且愉快的春節!也期待大家以最浪漫的心情、最堅毅的心理狀態迎接杜鵑花綻放的開學!

俊哲  敬上
2014.1.17

2013年10月29日 星期二

“堅毅 (GRIT)" - 臺大教學發展中心第 72 期編輯手札




圖文:張俊哲。
文/張俊哲 (臺大昆蟲學系副教授)


記得多年前剛考上校總區生化所的初期,我每天總想奮不顧身地趕到研究室,享受成為「天下第一所」研究生。不過,這樣的光榮感大抵在半年內就幾乎消失殆盡:面對天天做不出來的實驗、讀不懂的文獻、參不透的科學生涯,加上自稱「天下第一所」的研究單位愈來愈多,每天到學校的動力自然也愈來愈小。雖然從家裡到研究室的物理距離不變,但隨著每天要克服「最大靜摩擦力」的難度愈來愈高,到學校的難度也愈來愈高。

幸好,這樣的日子並沒有持續到口試的那一天。關鍵的轉捩點發生在碩二的上學期:某天,我懷著「孤臣孽子」的心情,走到生化所的地下室,把一個佈滿蜘蛛網和鐵鏽的水浴槽搬到自己的實驗桌,費了一翻功夫清理後,很訝異地發現這台被棄置的機器竟然還有正常的溫控功能。因為長期處於實驗失敗的狀態,我對生平第一次的核酸探針雜合 (probe hybridization) 實驗,幾乎不抱任何期待,只希望指導教授和審查委員能在幾個月後的口試高抬貴手,以「沒有功勞、也有苦勞 (甚或加上疲勞)」的角度,讓一個實驗技術和運氣都不佳的研究生過關。沒想到,兩天後在暗房裏看到洗片機緩緩所吐出來的底片,竟然有著出人意表的好結果。我頓時覺得暗房一點也不暗,而且隔天到學校的距離也短了許多。

雖然當年在飽嘗實驗挫敗後,一度覺得自己已能明白「孤臣孽子」的處境,但和 2010 年世界麵包金牌得主吳寶春的成長歷程一比,我覺得「自憐自艾」才是我的最佳寫照。讀了本期電子報刊載先生的口述歷史,很難想像一個十來歲便歲失去父親,出身貧困,沒錢看病,讀了放牛班仍近乎文盲,飽嚐人間辛酸的年輕人,竟然還能扭轉人生。我猜許多讀者應還沒有看完「編輯手札」,可能就已經轉台,想一睹麵包冠軍的傳奇故事。相信讀者們在看完文章後,應更能體會「自憐自艾」在真實的悲慘世界…..恕我直言:一點用也沒有。

那麼,怎樣才能讓我們從悲困的泥沼中脫身,甚或扭轉劣勢?在這裏,容我以「堅毅」 (GRIT) 二字作為問題的解答;或者,至少是解答之一。我的信心來自於吳先生的現身說法,以及 2013 麥克阿瑟天才獎 (MacArthur Genius Grant) 對華裔心理學家安琪拉.李.達克沃思 (Angela Lee Duckworth) 研究 ”GRIT” 的肯定。很巧的是,上星期我一時興起,查看今年諾貝爾獎得主是否有劍橋畢業生,以沾沾傑出校友的光,意外發現化學獎得主麥可李維特 (Michael Levitt) 當年從倫敦大學畢業後,竟然連番被劍橋「分子生物學研究室 (MRC Laboratory of Molecular Biology, 簡稱 LMB)」退回攻讀博士班的申請。一般人遭受這樣拒絕,大抵轉往「敵校」 (牛津大學),或飛越大西洋到美國另謀發展。然而李維特卻在連番遭拒之後仍不放棄,逕在 LMB 外頭搭起帳蓬,表達想加入 LMB 的堅強決心。後來,1962 年諾貝爾化學獎得主馬克思.佩魯 (Max Perutz) 終於答應收他為學生,使他一償宿願。坦白而言,加入劍橋大學並不是李維特拿諾貝爾獎最關鍵的因素,他獲獎的研究主要在以色列受到啟發和訓練,劍橋不過是他通往以色列做研究的一座橋梁而已。但從他用「搭帳篷以明志」的舉措,再次印證「堅毅」的特質對其生涯發展所產生的巨大功效。

在過去這幾年,我發覺年輕一輩的大學生逐漸對「努力」失去信心,總覺得再怎麼努力都和美好的未來遙遙無期。雖局勢的變化很難預測,但令人驚訝的是,絕大部分的同學都未曾真正努力過,就對這個遙遙無期的失敗堅信不移。失敗主義真的好像大型流感不斷地擴散,到現在疫情還在持續擴大中。可惜的是,雖已有許多例證顯示「堅毅」是克服失敗的「克流感」,很多人仍持懷疑的態度。誠如達克沃思女士所言,如何有效培養堅毅的性格仍有待探討;不過,缺乏誘因倒是一個既存的事實。我滿心期待教發中心電子報所刊載的許多文章,包括本期的「輕鬆建立良好師生關係」、「相見歡:認識台大學生」、有關教學創意媒體製作等兩篇報導,都可以像是各式各樣的催化劑,在讀者心中啟動「相信努力 (學習) 有用」的反應,也好比吳寶春先生當兵時的預官排長,願意帶他識字,參觀大學,使得受壓抑的「堅毅」得被催化,進而擺脫自卑,產生更大的動能,把原來最後一名的赤貧青年,推向世界第一。台灣真的一直需要這樣的見證。

俊哲
2013. 10. 27

註:安琪拉.李.達克沃思有關 GRIT 的演講詳參 http://www.ted.com/talks/angela_lee_duckworth_the_key_to_success_grit.html

2013年5月17日 星期五

The NTU Style : 蚜蟲成為新興發育模式物種的故事


 


全文請詳閱 "台大校友雙月刊 87 期"

張俊哲老師團隊之研究成果 (2002-2013)



研究成果刊登於期刊封面

* 通訊作者


+ 等同貢獻


Chang, C-c.*; Hsiao, Y. M.; Huang, T. Y.; Cook, C. E.; Shigenobu, S.; Chang, T. H. (2013) Noncanonical expression of caudal during early embryogenesis in the pea aphid Acyrthosiphon pisum: maternal cad-driven posterior development is not conserved. Insect Molecular Biology  (in press) (SCI)





Lu, H. L., Tanguy, S., Rispe, C., Gauthier, J., Walsh, T., Gordon, K., Edwards, O., Tagu, D.Chang, C-c.*, Jaubert-Possamai, S.* (2011) Expansion of Genes Encoding piRNA-Associated Argonaute Proteins in the Pea Aphid: Diversification of Expression Profiles in Different Plastic Morphs. PLoS ONE 6(12): e28051. doi:10.1371/journal.pone.0028051 (* co-corresponding authors)



科學影像刊登於教科書封面
Yi-Chung Chen, Bo-Kai Wu, Cheng-Ying Chu, Chia-Hsiung Cheng, Hau-Wei Han, Gen-Der Chen, Ming-Ting Lee, Pung-Pung Hwang, Koichi Kawakami, Chun-Che Chang, and Chang-Jen Huang* (2010) Identification and characterization of alternative promoters of zebrafish Rtn-4/Nogo genes in cultured cells and zebrafish embryos. Nucleic Acids Research 38:4635-4650. (SCI)

The International Aphid Genomics Consortium (2010) Genome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum. PLoS Biology 8(2): e1000313. doi:10.1371/journal.pbio.1000313. (Chun-che Chang is designated as a leader of the germline gene annotation group in the paper; Cover story; cover image of this issue is contributed by the Chang Lab) (SCI)



Ting-Yu Huang, Charles E. Cook, Gregory K. Davis, Shuji Shigenobu, Rita P.-Y. Chen, and Chun-che Chang* (2010) Anterior development in the parthenogenetic and viviparous form of the pea aphid, Acyrthosiphon pisumhunchback and orthodenticle expression. Insect Molecular Biology 19: 75-85. (SCI)



Shuji Shigenobu*, R. D. Bickel, J. A. Brisson, T. Butts, C.-c. Chang et al. (2010) Comprehensive survey of developmental genes in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum: frequent lineage-specific duplications and losses of developmental genes. Insect Molecular Biology 19: 47-62.

Yi-Chun Tsai, Leellen F. Solter, Chih-Yuan Wang, Huai-Sheng Fan, Chun-che Chang*, Chung-Hsiung Wang* (2009) Morphological and molecular studies of a microsporidium (Nosema sp.) isolated from the three spot grass yellow butterfly, Eurema blanda arsakia (Lepidoptera: Pieridae). Journal of Invertebrate Pathology 100: 85-93. (SCI)

Chun-che Chang*, Ting-Yu Huang, Charles E. Cook, Gee-Way Lin, Chun-Liang Shih, and Rita P.-Y. Chen (2009) Developmental expression of Apnanos during oogenesis and embryogenesis in the parthenogenetic pea aphid Acyrthosiphon pisum (Hemiptera: Aphidoidea). International Journal of Developmental Biology 53: 169-176. (SCI)

Taro Mito, Taro Nakamura, Isao Sarashina, Chun-che Chang, Shotaro Ogawa, Hideyo Ohuchi, and Sumihare Noji (2008) Dynamic expression patterns of vasa during embryogenesisin the cricket Gryllus bimaculatusDevelopment Genes Evolution 218: 381-387. (SCI)

Chun-che Chang*, Ting-Yu Huang, Chun-Liang Shih, Gee-Way Lin, Te-Pin Chang, Hui Chiu, Wen-Chang Chang (2008) Whole-mount identification of gene transcripts in aphids: Protocols and evaluation of probe accessibility. Archives of Insect Biochemistry and Physiology 68: 186-96. (SCI)

Chun-che Chang*, Hui Chiu, and How-Jing Lee (2008) Identification of nuage-like structures in the panoistic ovarioles of the German cockroach Blattella germanica (Linnaeus). Formosan Entomologist 28: 1-10. (Cover story)

Gee-Way Lin, Shau-Lin Lu, Ting-Yu Huang, Chun-Liang Shih, Wen-Jer Wu*, and Chun-che Chang* (2008) Molecular identification of weevils significant for customs inspection and quarantine importance. Formosan Entomologist 28: 43-55. (This paper was written in Chinese)


Chun-che Chang*, Gee-way Lin, Charles E. Cook, Shwu-bin Horng, How-jing Lee and Ting-yu Huang (2007) Apvasa marks germ-cell migration in the parthenogenetic pea aphid Acyrthosiphon pisum (Hemiptera: Aphidoidea). Development Genes Evolution 217: 275–287 (SCI)

Chun-che Chang*, Wen-chih Lee, Charles E. Cook, Gee-way Lin, and Tschining Chang (2006) Germ-plasm specification and germline development in the parthenogenetic pea aphid Acyrthosiphon pisum: Vasa and Nanos as markers. International Journal of Developmental Biology 50: 413-421. (Cover story
; cited by Cell (2006) and PNAS (2007)) (SCI)

 (2003 年以前的發表)
Chun-che Chang, Peter Dearden, and Michael Akam* (2002) Germline development in the grasshopper Schistocerca gregaria: Vasa as a marker. Developmental Biology 252: 110-118. (SCI) (Cover story)

Chun-che Chang and Charles E. Cook* (2002) Trends in genomic “evo-devo". 3 (7): reports 4019.1-4019.2. Genome Biology. (peer-reviewed) (SCI)